Los virus de la influenza, responsables de epidemias en nuestro pais sobre todo en invierno, se hallan asociados al aumento de las tasas de hospitalización y fallecimientos. En general la población afectada es la anciana o con patologías crónicas predisponentes. La mortalidad puede variar de año a año dependiendo de la agresividad del virus predominante. Sin embargo es difícil estimarla con exactitud  ya que no todos los casos son denunciados, las muestras enviadas a los laboratorios son escasas y su procesamiento es largo. Por otra parte muchos de estos pacientes de la población vulnerable pueden sufrir por ejemplo neumonía y fallecer de complicaciones secundarias como insuficiencia cardíaca, de última también asociadas a la influenza pero ya no comprobable porque la circulación del virus ya no es detectable, o la influenza no se asienta en los certificados de defunción.
Estudios epidemiológicos se pueden realizar a través de métodos estadísticos que calculan el exceso de mortalidad por neumonía comparando los picos de mortalidad en tiempos de epidemia con momentos no epidémicos aunque también se pueden subestimar las cifras justamente por la mortalidad por complicaciones no respiratorias asociadas a la neumonía

En Argentina el sistema de vigilancia de la influenza (FLU) comprende tres componentes: el sistema de vigilancia de enfermedad comunicables-el cual debería recibir casos denunciados-, la red de laboratorios de análisis de virus respiratorios y la red de unidades centinelas FLU, estas última reportan los casos que presentan síntomas de influenza y envían los hisopados nasales a los laboratorios de sistema.

La diversidad de los servicios de salud: públicos, de obras sociales, privados, prepagos, comunitarios, consultorios, etc., complican aún más la vigilancia epidemiológica.